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Reviewing MPC Vulnerability Score
Prioritization Tool - Selection Threshold Estimation and Enhancement Selection Approach
Cash Working Group - NW Syria- Mar 2025
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Practicing
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Prueba LAB 1
DotsPlot可视化marker基因
点图的构成
x 轴:
通常表示不同的细胞群(clusters)或样本(samples)。
每个柱子代表一个细胞群。
y 轴:
表示基因名称。
每个点代表一个基因在一个细胞群中的表达情况。
点的大小:
表示基因在某个细胞群中表达的细胞比例(表达频率)。
点越大,表示该基因在该细胞群中表达的细胞比例越高。
点的颜色:
表示基因在某个细胞群中的平均表达量。
颜色越深(通常为红色),表示平均表达量越高;颜色越浅(通常为蓝色),表示平均表达量越低。
表达频率(点的大小):
点的大小反映了基因在某个细胞群中表达的细胞比例。
例如,如果一个基因在某个细胞群中的点很大,说明该基因在该细胞群中广泛表达。
平均表达量(点的颜色):
点的颜色反映了基因在某个细胞群中的平均表达水平。
例如,如果一个基因在某个细胞群中的点颜色很深(红色),说明该基因在该细胞群中高表达。
细胞群特异性:
如果一个基因在某个细胞群中的点既大又深,说明该基因在该细胞群中特异性高表达。
例如,CD3D 和 CD3E 在 T 细胞群中的点通常既大又深,表明它们是 T 细胞的特异性标记基因。
跨细胞群的比较:
通过比较不同细胞群中点的大小和颜色,可以了解基因在不同细胞群中的表达模式。
例如,MZB1 和 IGHG1 在浆细胞群中通常高表达,而在其他细胞群中表达较低。