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Análisis de Expresión Diferencial en Telencéfalo de Ratón con DESeq2: En la búsqueda del papel de los genes sin intronesnt
Análisis de Expresión Diferencial en Telencéfalo de Ratón con DESeq2: Explorando el Papel de los Genes sin Intrones
Dra. Katia Aviña Padilla
Fecha: 08 de Noviembre, 2024
Descripción: Este tutorial ofrece una guía detallada sobre el análisis de expresión diferencial de RNA-seq en el telencéfalo de ratón, centrada en el uso del paquete DESeq2 en R. A lo largo del tutorial, se cubren los pasos esenciales, desde la normalización y el análisis de expresión diferencial hasta la visualización de resultados, con un enfoque en la identificación de genes sin intrones que se expresan diferencialmente en estadios embrionarios clave.
Objetivo del Estudio: La investigación se centra en la identificación de genes diferencialmente expresados entre las condiciones experimentales M9.5 y M10.5, que representan estadios específicos del desarrollo embrionario en ratones (medidos en días post coitum, dpc). Este análisis busca resaltar genes sin intrones que desempeñan roles significativos en la diferenciación celular y el desarrollo temprano del telencéfalo. La elección de estos estadios, con cambios específicos en fracciones de día, permite captar la dinámica de la organogénesis en un sistema nervioso en formación.
Para un análisis más profundo y una interpretación detallada de los resultados, se recomienda revisar el artículo relacionado en Frontiers in Genetics.